214
szerkesztés
Módosítások
a
→MPI feladatok
</pre>
==== MPI OpenMPI feladatok ====
MPI feladatok esetén meg kell adnunk az egy node-on elinduló MPI processzek számát is (<code>#SBATCH --ntasks-per-node=</code>). A leggyakoribb esetben ez az egy node-ban található CPU core-ok száma. A párhuzamos programot az <code>mpirun</code> paranccsal kell indítani.
#SBATCH -o slurm.out
mpirun ./a.out
</pre>
==== SGI MPT MPI feladatok (Debrecen) ====
MPI feladatok esetén meg kell adnunk az egy node-on elinduló MPI processzek számát is (<code>#SBATCH --ntasks-per-node=</code>). A leggyakoribb esetben ez az egy node-ban található CPU core-ok száma. A párhuzamos programot az <code>mpirun</code> paranccsal kell indítani. Az SGI MPT MPI paraméterezése kicsit más, mint az OpenMPI. '''Debrecen az SGI MPT az alpértelmezett MPI környezet!'''
===== Példa =====
Bob felhasználó a barfoo számla terhére 2 node-ot, 12 órára foglal le egy MPI job számára. Az egyes node-okon 24 MPI szálat fog elindítani. A program stdout kimenetét a <code>slurm.out</code> fájlba irányítja (<code>#SBATCH -o</code>).
<pre>
#!/bin/bash
#SBATCH -A barfoo
#SBATCH --job-name=mpi
#SBATCH -N 2
#SBATCH --ntasks-per-node=24
#SBATCH --time=12:00:00
#SBATCH -o slurm.out
source /opt/nce/bin/machines
export MPI_OPT="${MACHINES} -np ${SLURM_NTASKS_PER_NODE}"
mpirun ${MPI_OPT} ./a.out
</pre>
