Módosítások

A frissítéseket a következő paranccsal tudjuk letölteni:

shfmgr -u

==== SSH elérés beállítása ====

Új SSH MID-et a következő paranccsal tudunk létrehozni:

sshmgr -n <MID>

</source>

A következő beállításokat kell beleírni a MID fájlba:

# a távoli gép IP címe vagy DNS neve

mid_ssh_fqdn="skynet.cyberdy.ne"

# explicit ellenőrzés

mid_ssh_port_check="ping"

Amennyiben nincs még SSH kulcsunk a szkript létrehozza ezt. Az SSH kulcsokat a

<tt>$HOME/shf3/key/ssh</tt> könyvtár alatt találjuk: privát kulcs: <tt><MID>.sec</tt>, publikus kulcs: <tt><MID>.pub</tt>. A publikus részt kell eljuttatni a távoli gépre ill. elküldeni a regisztráció során. Ha vannak már kulcsaink, akkor ebbe a könyvtárba kell másolni az előbb említett nevekkel. Az SSH MID-ek a <tt>$HOME/shf3/mid/ssh</tt> könyvtár alatt vannak a <tt><MID></tt> nevű fájlokban. Minden SSH-val kapcsolatos parancs ezekt a fájlokat olvassa és használja a kulcsokat, ha elérhetők.

Az alapértelmezett MPI könyvtár az SGI MPT. Ez a könyvtár biztosítja a legjobb teljesítményt az UV gépen. A felhasználói programokat ehhez a könyvtárhoz kell fordítani. Fordításhoz az Intel Link Advisor-t érdemes használni. Az ajánlott fordítás opciók:

CFLAGS=-O2 -xSSE4.2

FFLAGS=-O2 -xSSE4.2

$(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_blacs_sgimpt_lp64.a -Wl,--end-group \

-lpthread -lm

=== MPI SGE job szkript példa ===

#!/bin/bash

### SGE

# 384 MPI szál fog elindulni

mpirun 384 dplace -s 1 <APP>

Az `<APP>` helyére kell írni a futtatandó programot és paramétereit. A `dplace` egy SGI előtétprogram, ami az MPI szálak ideális CPU elosztását végzi, megadása javasolt, mert általában javítja a teljesítményt.

=== OMP SGE job szkript példa ===

#!/bin/bash

### SGE

export OMP_NUM_THREADS=192

omplace <APP>

Az `omplace` egy SGI előtétprogram, ami az MPI szálak ideális CPU elosztását végzi, megadása javasolt, mert általában javítja a teljesítményt.

[[Category: HPC]]

[[Category: HOWTO]]