214
szerkesztés
Módosítások
→SGI UV Pécs
A pécsi gépen csak SMP vagy MPI programok futtatása engedélyezett. Minimálisan 12 szálat lehet lefoglalni. A foglalás alapegysége a numa node, ami 2x6 processzort és 60GB memóriát tartalmaz. Érdemes 12 többszörösével számolni a lefoglalalndó szálakat, pl.: 12, 24, 48, 96... Ha 2 hatványaira van szükségünk, akkor az SGE foglalást a legközelebbi 12-es szálszámmal kérjük, és az MPI-t vagy az OMP paraméterezzük 2^n szerint.
Az alapértelmezett MPI könyvtár az SGI MPT. Ez a könyvtár biztosítja a legjobb teljesítményt az UV gépen. A felhasználói programokat ehhez a könyvtárhoz kell fordítani.Fordításhoz az Intel Link Advisor-t érdemes használni. Az ajánlott fordítás opciók: <source lang=bash> CFLAGS=-O2 -xSSE4.2 FFLAGS=-O2 -xSSE4.2 LDFLAGS=$(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_scalapack_lp64.a \ -Wl,--start-group $(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_intel_lp64.a \ $(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_sequential.a \ $(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_core.a \ $(MKLROOT)/lib/intel64/libmkl_blacs_sgimpt_lp64.a -Wl,--end-group \ -lpthread -lm</source>
=== MPI SGE job szkript példa ===
